Η εσωτερική αρτηριακή ουρά εξυπηρετεί οξυγονωμένο αίμα στα εξωτερικά γεννητικά όργανα τόσο των ανδρών όσο και των θηλυκών. Διακλαδίζεται από την εσωτερική λαγόνια αρτηρία.
Αυτή η αρτηρία τείνει να είναι μικρότερη στις γυναίκες και μερικά από τα κλαδιά της αρτηρίας είναι ειδικά για κάθε φύλο. Στα αρσενικά, τα κλαδιά της εσωτερικής βάσης περιλαμβάνουν τη ραχιαία και τη βαθιά αρτηρία του πέους, ενώ τα θηλυκά έχουν ραχιαία και βαθιά αρτηρία της κλειτορίδας. Οι γυναίκες έχουν οπίσθια χειλιακά κλαδιά, ενώ οι άνδρες έχουν κλαδιά οσχέου. Υπάρχουν επιπλέον άλλα αγγεία ειδικά για τα γεννητικά όργανα.
Οι κατώτερες ορθικές και περινεϊκές αρτηρίες που διακλαδίζονται από την εσωτερική βάση είναι ίδιες και στα δύο φύλα.