Διακλαδίζοντας από την εσωτερική λαγόνια αρτηρία, η αρτηρία του αποφρακτήρα τρέχει κατά μήκος του πυελικού τοιχώματος. Τρέχει στο ανώτερο τμήμα του βραχίονα του αποφρακτήρα, το οποίο είναι ένα άνοιγμα για τα αιμοφόρα αγγεία και τα νεύρα μεταξύ των οστών του ισχίου και της ηβικής, που βρίσκονται στο κάτω μέρος της λεκάνης. Η αρτηρία του αποφρακτήρα, ωστόσο, βγαίνει από την πυελική κοιλότητα μέσω του καναλιού του αποφρακτήρα, ένα μικρό άνοιγμα στον συνδετικό ιστό που καλύπτει τον ενδομυϊκό μυ του αποφρακτήρα. Το κανάλι του αποφρακτήρα βρίσκεται κοντά στα όργανα του αποφρακτήρα.
Η αρτηρία του αποφρακτήρα χωρίζεται σε πρόσθια και οπίσθια κλαδιά. Όχι μόνο η αρτηριακή μεμβράνη μεταφέρει οξυγονωμένο αίμα στα κλαδιά της, εξυπηρετεί επίσης την περιοχή της λεκάνης.
Αυτή η αρτηρία δεν είναι η ίδια με τη φλέβα του αποφρακτήρα, η οποία ξεκινά από την άνω περιοχή του μηρού και ρέει στην πυελική περιοχή. Η φλέβα του αποφρακτήρα αποστραγγίζει μεγάλο μέρος του αίματος που εκπέμπεται από την αντίστοιχη αρτηρία του, αλλά μόνο μετά την εξάντληση του οξυγόνου στο αίμα.
Η αρτηρία του αποφρακτήρα μπορεί να τρέξει διαφορετικά σε ορισμένα άτομα. Εάν ναι, αυτό είναι συγγενές, που σημαίνει ότι αυτά τα διαφορετικά μονοπάτια υπάρχουν από τη γέννηση. Οι διαφορετικοί τρόποι με τους οποίους μπορεί να τοποθετηθεί η αρτηρία δεν μειώνουν σημαντικά την ικανότητα ροής της.